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植物基因表达与染色质状态

  • 报告题目:植物基因表达与染色质状态
  • 系列:“生态与环境讲坛”系列第 198
  • 报告人:董志诚 研究员
  • 时间:4月20日(周五)上午9:30-10:30
  • 地点:厦门大学翔安校区金泉楼A239
  • 来访单位:广州大学生命科学学院
  • 邀请人:李庆顺 教授
  • 摘要:RNA polymerase II (Pol II) plays an essential role in gene expression. We adapted plant native elongating transcript sequencing and global run on sequencing to profile nascent RNA genome wide in Arabidopsis. We found Pol II tends to accumulate downstream of transcription start site (TSS). Pol II with unphosphorylated carboxyl-terminal domain (CTD) mainly accumulates downstream the TSS, while Ser5P CTD Pol II associates with spliceosome, and Ser2P CTD Pol II presents a sharp peak within 250 bp downstream of polyadenylation site. Both 5’ pause and 3’ pause of Pol II are important regulatory steps for transcription. Active genes can be classified into three clusters based on different transcription models. In summary, we demonstrated these two methods are suitable to study RNA Pol II dynamics in planta. Although transcription is overall conserved within eukaryotes, there are potential plant specific regulatory mechanisms.
  • 简介:学习/工作经历:
    1996 年,上海交通大学,学士;
    2003年,中国科学院上海植物生理与生态研究所,博士;
    2004-2008年,美国宾夕法尼亚州立大学Nina Fedoroff实验室,博士后;
    2008-2012年,美国布朗大学Judith Bender实验室,博士后;
    2012-2018年,中国科学院华南植物园,研究员。此后,历任华南植物园分子分析与遗传改良中心副主任和中国科学院华南农业植物分子分析与遗传改良重点实验室副主任;
    2018年, 广州大学生命科学学院,教授。

    研究聚焦: 1.植物表观遗传学与基因表达调控;2.大豆重要农艺性状的调控网络;3.利用重组酶或CRISPR/ Cas9系统进行作物基因组编辑。

    研究成果:部分分工作发表于Proc Natl Acad Sci USA, PLoS Genetics, Nuleic Acids Research, Molecular Plants, Plant Physiology, EMBO J等国际权威期刊。
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